Fungal Genome Collection
University of Nebraska Lincoln
School of Biological Sciences and Center for Plant Science Innovation
Home About FGC Use Cases Species List

Ortholog candidates: locus specific
Species:
Saccharomyces cerevisiae S288C
Locus:
YLR410W
Length:
1770
Description:
YLR410W-B YLR410W-B SGDID:S000007380, Chr XII from 941483-942775,942777-946796, Genome Release 64-1-1, transposable_element_gene, "Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes; transcribed/translated as one unit; polyprotein is processed to make a nucle ......
% identity [30 - 100]:
Align/hit length ratio [0.3 - 1.0]:
Percent identity color legend
>90
>80
>70
>60
>50
>40
>30
color ledgen
Phylogenetic tree
Mca
Mgy
Tto
Teq
Tru
Cr2
Cr3
Ch5
Crs
Cpo
Cpr
HcaG
HcaH
HcaH8
HcaN
BdeE
BdeS
Pbr1
Pbr18
Pbr3
Ang
Acl
Afl
Aor
Ate
Nfi
Afu
Aca
Ani
Ede
Fox
Fve
Fgr
Tvi
Vda
Cgl
Ncr
Mor
Mpo
Ggr
Bci
Ssc
Mfi
Mga
Sno
Abr
Che
Ptr
Yli
C21
Cw1
Ctr
Cpa
Lel
Cgu
Clu
Dha
Ago
Wan
Sc2
Sce
Kla
Cag
Soc
Spo9
Sja
Scr
Crn
Tme
Cci
Sco
Lbi
Sla
Abi
Abj
Pos
Csu
Han
Uma
Mgl
Ppl
Wco
Ade
Sro
Pgt
Ptt
Ror
Pbl
Mci
Bde
Spu
Ama
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
Candidate List
Sce    YLR410W
Cr3    CISG_06244
HcaH8    HCEG_04703
BdeE    BDCG_09366
BdeS    BDBG_09179
Pbr1    PAAG_01513
Pbr18    PADG_00268
Pbr3    PABG_03574
Ang    fge1_pg_C_1001211
Aca    6138
Ede    HMPREF1120_08518
Fox    FOXG_08607
Fve    FVEG_06062
Sno    SNOG_08454
Yli    YALI0B13464g
C21    orf19.980
Cw1    CAWG_04413
Ctr    CTRG_05240
Cpa    CPAG_00345
Lel    LELG_03856
Cgu    PGUG_02174
Clu    CLUG_03421
Ago    ERGO0E10252g
Wan    27075
Sc2    SCRG_04349
Kla    KLLA0B02805g
Cag    CAGL0M09823g
Soc    SOCG_03851
Spo9    SPCC1672_06c
Sja    SJAG_00244
Scr    SPOG_05458
Csu    80527
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
color ledgen
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq
Seq